<div dir="ltr"><div dir="ltr">Hi Sam,<div><br></div><div>Great! Can you provide the full log during installation? Also, in the installer directory after running the installer, there will be a &quot;base_tmp&quot; directory that has 2 log files. Can you post or send me the log output? I&#39;d like to pinpoint which script is looking specifically for /usr/bin/python. I also want to make sure that the installer works regardless of the Python version used to run the installation script.</div><div><br></div><div>Hi Murpholino,</div><div><br></div><div>We are in the process of migrating Phenix to Python 3, but we want to make sure everything works the same before making Python 3 installers available to everyone. We have migrated CCTBX to work in Python 3 and we are running continuous integration with Python 3.6, 3.7, and 3.8 on Azure Pipelines on all platforms. Here&#39;s some example output from Azure Pipelines for some upcoming changes (<a href="https://dev.azure.com/cctbx/cctbx_project/_build/results?buildId=4561&amp;view=results">https://dev.azure.com/cctbx/cctbx_project/_build/results?buildId=4561&amp;view=results</a>). We&#39;ll be using the same approach to testing Phenix to ensure consistency while we make the changes for Python 3 compatibility.</div><div><br></div><div>Thanks for your patience!</div><div><br></div><div><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div><div>--</div><div><span style="font-size:12.8000001907349px">Billy K. Poon</span><br></div></div><div>Research Scientist, Molecular Biophysics and Integrated Bioimaging</div><div>Lawrence Berkeley National Laboratory</div><div>1 Cyclotron Road, M/S 33R0345</div><div>Berkeley, CA 94720</div><div>Tel: (510) 486-5709</div><div>Fax: (510) 486-5909</div><div>Web: <a href="https://phenix-online.org" target="_blank">https://phenix-online.org</a></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div><br></div></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Wed, May 6, 2020 at 2:23 AM Sam Tang &lt;<a href="mailto:samtys0910@gmail.com" target="_blank">samtys0910@gmail.com</a>&gt; wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi<br clear="all"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div><br><div>Many thanks! I&#39;ve got Phenix installed after switching back to python2.</div><div><br></div><div>Brs</div><div><br></div><div>Sam</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Wed, 6 May 2020 at 01:03, Murpholino Peligro &lt;<a href="mailto:murpholinox@gmail.com" target="_blank">murpholinox@gmail.com</a>&gt; wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Hi Sam.</div><div>Fedora is dropping support for the *old* python (i.e. python2). <br></div><div><a href="https://fedoraproject.org/wiki/Changes/RetirePython2" target="_blank">https://fedoraproject.org/wiki/Changes/RetirePython2</a></div><div>You have to install python2 in your fedora `sudo dnf install python27` will do the trick.</div><div> I have successfully installed Phenix in F32.</div><div>I wonder when Phenix is going to move to python 3? I know is not an easy task.<br></div><div><br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">El mar., 5 de may. de 2020 a la(s) 08:06, Sam Tang (<a href="mailto:samtys0910@gmail.com" target="_blank">samtys0910@gmail.com</a>) escribió:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi<div><br></div><div>I am installing Phenix on a Fedora 30 station. It complains line 15: /usr/bin/python: No such file or directory. I have checked that there is python3.7.3 pre-loaded. So did I miss anything obvious...?</div><div><br></div><div>Brs</div><div><br></div><div>Sam</div></div>
_______________________________________________<br>
phenixbb mailing list<br>
<a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org" target="_blank">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
<a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" rel="noreferrer" target="_blank">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br>
Unsubscribe: <a href="mailto:phenixbb-leave@phenix-online.org" target="_blank">phenixbb-leave@phenix-online.org</a></blockquote></div>
</blockquote></div>
_______________________________________________<br>
phenixbb mailing list<br>
<a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org" target="_blank">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
<a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" rel="noreferrer" target="_blank">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br>
Unsubscribe: <a href="mailto:phenixbb-leave@phenix-online.org" target="_blank">phenixbb-leave@phenix-online.org</a></blockquote></div>