<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" style="display:none;"> P {margin-top:0;margin-bottom:0;} </style>
</head>
<body dir="ltr">
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
Hello,</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
I have an unusual problem in which my enzyme (a dimer) is covalently bound to its own C-terminus and so is daisy-chained across the crystal lattice. In the past, I have encountered and fixed this problem by extracting the covalent part of the molecule and re-phasing
 using that as the molecular replacement model. In this case, I am not able to due so. When I input the restraints, it either crashes refine or attempts to impose them on the corresponding residues within the ASU (understandable) but they are quite distal and
 this leads to &quot;interesting&quot; refinement results. Is there a good way of making phenix.refine do what I want? Or perhaps a workaround that I haven't considered yet?</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
Best Regards,</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
Brandon</div>
</body>
</html>