<html>
  <head>
    <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html;
      charset=windows-1252">
  </head>
  <body>
    Hi Brandon,<br>
    <br>
    <blockquote type="cite"
cite="mid:CH2PR22MB203719BD7F07E486C80BAE1FBCB70@CH2PR22MB2037.namprd22.prod.outlook.com">
      <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html;
        charset=windows-1252">
      <style type="text/css" style="display:none;"> P {margin-top:0;margin-bottom:0;}</style>I
      have an unusual problem in which my enzyme (a dimer) is covalently
      bound to its own C-terminus and so is daisy-chained across the
      crystal lattice. In the past, I have encountered and fixed this
      problem by extracting the covalent part of the molecule and
      re-phasing using that as the molecular replacement model. In this
      case, I am not able to due so. When I input the restraints, it
      either crashes refine or attempts to impose them on the
      corresponding residues within the ASU (understandable) but they
      are quite distal and this leads to "interesting" refinement
      results. Is there a good way of making phenix.refine do what I
      want? Or perhaps a workaround that I haven't considered yet?<br>
    </blockquote>
    <br>
    this should be possible but I don't remember what it takes. If you
    send me the file I might be able to figure this out.<br>
    <br>
    Pavel<br>
  </body>
</html>