<html>
  <head>
    <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html;
      charset=windows-1252">
  </head>
  <body>
    Hi Alexei,<br>
    <br>
    <blockquote type="cite"
cite="mid:YQXPR0101MB07574A48020B1DB7E7EFCA84B2940@YQXPR0101MB0757.CANPRD01.PROD.OUTLOOK.COM">
      <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html;
        charset=windows-1252">
      <style type="text/css" style="display:none;"> P {margin-top:0;margin-bottom:0;} </style>
      <div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif;
        font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
        When refining a model against a density-modified cryo-EM map,
        should one use the resolution of the original or modified map?</div>
    </blockquote>
    <br>
    phenix.real_space_refine uses the resolution only to calculate and
    report map-model correlation coefficient. The resolution you specify
    does not affect refinement results in any way. It's best though to
    provide the resolution of the map that is used in refinement.<br>
    <br>
    Pavel<br>
    <br>
  </body>
</html>