<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body>
<div dir="auto">
<div>Hi Pavel,&nbsp;</div>
<div dir="auto">When I marked explicitly 'no ano' in the gui (whenever I didn't want to use anomalous), this doubling on the output file was gone. As I recall it also depends on the labels one chooses to use from the data file. This was on older builds though.</div>
<div dir="auto">Cheers,</div>
<div dir="auto">Boaz<br>
<br>
<div data-smartmail="gmail_signature" dir="auto">Boaz Shaanan, Ph.D.<br>
Department of Life Sciences<br>
Ben Gurion University of the Negev<br>
Beer Sheva<br>
Israel</div>
<div class="gmail_quote" dir="auto">---------- Forwarded message ----------<br>
From: בעז שאנן &lt;bshaanan@bgu.ac.il&gt;<br>
Date: Oct 20, 2020 17:48<br>
Subject: Re: [phenixbb] Number of unique reflections<br>
To: Armando Albert &lt;xalbert@iqfr.csic.es&gt;<br>
Cc: <br>
<br type="attribution">
<blockquote class="quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div>
<div>
<div dir="auto">Hi, Assuming that you don't want to use anomalous differences during refinement, I found out that the easiest (and safest) way to avoid this duplication is to mark in the gui&nbsp; 'no anom' under options when you define the data file. There may
 be other ways but this has worked for me.
<div dir="auto">Stay safe,</div>
<div dir="auto">Boaz<br>
<div dir="auto"><br>
<br>
<div dir="auto">Boaz Shaanan, Ph.D.<br>
Department of Life Sciences<br>
Ben Gurion University of the Negev<br>
Beer Sheva<br>
Israel</div>
</div>
</div>
</div>
<div><br>
<div>On Oct 20, 2020 17:35, Armando Albert &lt;xalbert@iqfr.csic.es&gt; wrote:<br type="attribution">
</div>
</div>
</div>
<font size="2"><span style="font-size:10pt">
<div>Dear all, <br>
We have realise that the output&nbsp; mtz and mmcif files duplicate the number of miller indices (the number of unique reflections) with respect to those in the mtz input file. We guessed that this correspond to the friedel pairs, but it is annoying for pdb submission,
 as the server warns that the observations measured are less that those used in the refinement.<br>
What shall we do fro correct this issue?<br>
Armando<br>
<br>
<br>
_______________________________________________<br>
phenixbb mailing list<br>
phenixbb@phenix-online.org<br>
<a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br>
Unsubscribe: phenixbb-leave@phenix-online.org<br>
</div>
</span></font></div>
</blockquote>
</div>
<br>
</div>
</div>
</body>
</html>