<div dir="auto"><span style="font-family:sans-serif;font-size:12.8px">Dear BB,</span><div dir="auto" style="font-family:sans-serif;font-size:12.8px">I am using phenix real space refinement for refining a cryo-EM model of protein-DNA complex. However after refinement the structure of the dna strands are twisted in a very bad geometry compared to the initial input model.</div><div dir="auto" style="font-family:sans-serif;font-size:12.8px">I am using version 1.8 for this project, also tried couple of other versions as well, but the same problem happened.</div><div dir="auto" style="font-family:sans-serif;font-size:12.8px">How to rectify this issue? </div><div dir="auto" style="font-family:sans-serif;font-size:12.8px">Thank you. </div><div dir="auto" style="font-family:sans-serif;font-size:12.8px">Jobi </div></div>