<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" style="display:none;"> P {margin-top:0;margin-bottom:0;} </style>
</head>
<body dir="ltr">
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
hello team phenix,</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
I hope this&nbsp;email finds you well.&nbsp;</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
I recently downloaded phenix for analysing our cryoEM data, before moving to the data analysis I decided to try the tutorial. I decided to use the autosharpen option first, I was able to access the tutorial but when I clicked&nbsp;on coot I repeatedly got a message
 saying that &quot;Sorry: the 'coot' command could not be located.&nbsp;</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
We have installed Coot to run on a CentOS platform and has the latest version of Coot on the system. I am a novice with linux and phenix. So any help in this regard would&nbsp;be highly&nbsp;appreciated. Do let me&nbsp;know if&nbsp;you have any questions.&nbsp;</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
Regards,</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
Maulik</div>
<div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<br>
</div>
<div id="Signature">
<div>
<div></div>
<div id="divtagdefaultwrapper" dir="ltr" style="color:rgb(0,0,0); font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif">
<p style="font-size:12pt; margin-top:0px; margin-bottom:0px"><span style="font-size:12pt"></span></p>
<p style="margin:0cm 0cm 0.0001pt; font-family:Calibri,sans-serif; color:rgb(32,31,30); text-align:start; background-color:rgb(255,255,255)">
<span style="font-size:14.6667px; color:rgb(51,51,51)"><b>Maulik D. Badmalia</b></span></p>
<p style="font-size:12pt; margin:0cm 0cm 0.0001pt; font-family:Calibri,sans-serif; color:rgb(32,31,30); text-align:start; background-color:rgb(255,255,255)">
<span lang="EN-US" style="margin:0px; font-size:11pt; color:rgb(51,51,51)"><b>Postdoctoral Researcher</b></span></p>
<p style="font-size:12pt; margin:0cm 0cm 0.0001pt; font-family:Calibri,sans-serif; color:rgb(32,31,30); text-align:start; background-color:rgb(255,255,255)">
<span style="margin:0px; font-size:11pt; color:rgb(51,51,51)"><b>Laboratory of Medicinal Biophysics</b></span></p>
<p style="font-size:12pt; margin:0cm 0cm 0.0001pt; font-family:Calibri,sans-serif; color:rgb(32,31,30); text-align:start; background-color:rgb(255,255,255)">
<span lang="EN-US" style="margin:0px; font-size:11pt; color:rgb(51,51,51)"><b>Alberta RNA Research and Training Institute</b></span></p>
<p style="font-size:12pt; margin:0cm 0cm 0.0001pt; font-family:Calibri,sans-serif; color:rgb(32,31,30); text-align:start; background-color:rgb(255,255,255)">
<span lang="EN-US" style="margin:0px; font-size:11pt; color:rgb(51,51,51)"><b>Dept. of Chemistry &amp; Biochemistry</b></span></p>
<p style="font-size:12pt; margin:0cm 0cm 0.0001pt; font-family:Calibri,sans-serif; color:rgb(32,31,30); text-align:start; background-color:rgb(255,255,255)">
<span lang="EN-US" style="margin:0px; font-size:11pt; color:rgb(51,51,51)"><b>University of Lethbridge, Lethbridge, AB, Canada</b></span></p>
<div style="font-size:12pt"><br>
</div>
<br>
<p style="font-size:12pt; margin-top:0px; margin-bottom:0px"></p>
</div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>