<html><head></head><body><div class="yahoo-style-wrap" style="font-family:Helvetica Neue, Helvetica, Arial, sans-serif;font-size:13px;"><div dir="ltr" data-setdir="false"><div dir="ltr" data-setdir="false"><br><div>Dear All,<br><br>I have tried to install Rosetta for phenix use based on the guide in&nbsp; https://www.phenix-online.org/documentation/reference/rosetta_install.html.<br><br>After the "tar xzf..." command, I added the directory for the installed rosetta (something like "export PHENIX_ROSETTA_PATH=/your-path-to-rosetta-here/") to my .bashrc (and in fact I also have added into /bash_profile) and sourced it.<br><br>For the final step to build the interface for rosetta_refine, as for my gcc version is 8.3.1, I have deleted the original site.settings in the directory ${PHENIX_ROSETTA_PATH}/main/source/tools/build/, and exactly copied the content in https://www.phenix-online.org/documentation/extras/site.settings and save it as site.settings in the directory ${PHENIX_ROSETTA_PATH}/main/source/tools/build/.<br><br>Command "nproc" displays 12, then I run "rosetta.build_phenix_interface nproc=12". In the running step for the above command, I remember it asked me "whether to install "sed" (I do not what is "sed" for), I answer "y" and "enter", it seems like the computer stopped. I opened another terminal, and all commands like "ls","cd" failed to work.<br><br>I restarted the computer, but I cannot log into my centos username account anymore.<br><br>I restarted the computer by initiating the centos secure start system, and deleted the export directory for the rosetta from the .bashrc and .bash_profile. In this way I restarted the computer and I can log into my centos user name account as usual. But as you know, my rosetta still did not work.<br><br>Thus, will you please advice what is wrong for my installation fof the rosetta (for phenix use) and how to make it workable?<br><br>I am looking forward to getting your reply.<br><br>Best wishes,<br><br>Smith</div><div><br></div><br><br><br><br></div><div><br></div></div></div></body></html>