<div dir="ltr">Dear all,
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">I am trying to run
MR-Rosetta using the gui;</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">[ROSETTA_VERSION]:
2021.16+release.8ee4f02</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">Phenix version
1.19.2-4158</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">running on  Ubuntu
20.04.2 LTS (20.04, focal)</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%"><br>

</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%"> rosetta.run_tests
seems to run without errors.</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%"><br>

</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">As inputs, I use a
HHpred file, a reflection file, a sequence (FASTA) file and I tried
also providing directly the fragments files from the Robetta server.</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%"><br>

</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">After generating
some starting models, the runs keep crashing during the rebuild stage
giving the error messages below.</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%"><br>

</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">Is there a way to
troubleshoot this? It does generate some initial models, so it seems
to correctly read the HHPred file and the fasta file.</p><p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%"><br></p><p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">Thank you in advance,</p><p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">Andrea<br></p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%"><br>

</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%"><br>

</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">non-zero return
code: 139</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">Failed to run
REBUILD</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%"><br>

</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">from rebuild.log</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">AN INTERNAL ERROR
HAS OCCURED. PLEASE SEE THE CONTENTS OF ROSETTA_CRASH.log FOR
DETAILS.</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">Segmentation fault
(core dumped)</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%"><br>

</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">from
ROSETTA_CRASH.log:</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%"><br>

</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">[END_BACKTRACE]</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%"><br>

</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">[FILE]: SIGSEGV</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">[LINE]: 11</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">[START_MESSAGE]</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">Segmentation Fault</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%"><br>

</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">[END_MESSAGE]</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">[END_CRASH_REPORT]</p></div>