<div dir="ltr">Hi all,<div><br></div><div>I&#39;m using phenix.real_space_refine to refine a model into a cryo-EM map. My local map resolution is highly variable across the molecule, and using a single map weight (the parameter shown in the Refinement Settings &gt; &quot;Other Options&quot; in the GUI) on the whole model leads to poor map-to-model fit in some locations and overfitting in others. Potential solutions could be to:</div><div>1. assign different map weights to different segments of the model (based on a user-specified atom selection)</div><div>OR</div><div>2. perform iterative refinements with different weight settings, holding different (user-specified) segments of the model fixed during each iteration (I suspect this isn&#39;t possible based on Pavel&#39;s message here: <a href="http://phenix-online.org/pipermail/phenixbb/2021-May/025037.html">http://phenix-online.org/pipermail/phenixbb/2021-May/025037.html</a>)</div><div><br></div><div>Is either of these approaches (or another one that accomplishes the same goal) possible? I am using the Phenix GUI, but if this is only possible in command line, and you&#39;re willing to share an example command that accomplishes either of these tasks, please let me know.</div><div><br></div><div>Thanks!</div><font color="#888888"><div>-Josh</div><div><br></div><div>(also, apologies if this is a duplicate message...still trying to figure out the phenixbb listserv)</div></font></div>