<html>
  <head>
    <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8">
  </head>
  <body>
    Hi Tristan,<br>
    <br>
    in CCTBX you can find if an atom (or, generally, a point in space)
    belongs to a special position.<br>
    <br>
    Pavel<br>
    <br>
    <div class="moz-cite-prefix">On 3/22/20 05:49, Tristan Croll wrote:<br>
    </div>
    <blockquote type="cite"
      cite="mid:0bc851626304e917285a1059d74c999d@cam.ac.uk">
      <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8">
      <p>If there isn't already a pre-existing method in CCTBX, I
        recently did something along these lines using ChimeraX and
        Clipper (drawing all the symmetry axes in a unit cell - see
        attached example). The source code is at <a
href="https://github.com/tristanic/chimerax-clipper/blob/master/src/geometry/symmetry_axes.py"
          moz-do-not-send="true">https://github.com/tristanic/chimerax-clipper/blob/master/src/geometry/symmetry_axes.py</a>
        - should be fairly straightforward to port the logic to CCTBX.</p>
      <div id="signature"> </div>
      <p><br>
      </p>
      <p id="reply-intro">On 2020-03-22 12:00, Collins, Steve
        (DLSLtd,RAL,SCI) wrote:</p>
      <blockquote type="cite" style="padding: 0 0.4em; border-left:
        #1010ff 2px solid; margin: 0">
        <div id="replybody1">
          <style type="text/css">#replybody1 P {margin-top:0;margin-bottom:0;}</style>
          <div dir="ltr">
            <div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica,
              sans-serif; font-size: 12pt; color: #000000;">Hello,</div>
            <div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica,
              sans-serif; font-size: 12pt; color: #000000;">I'm trying
              to find something I can run from Python to get all the
              special (high-symmetry) positions and usual (e.g. Wyckoff)
              labels for a particular space group. I can't find this in
              the sgtbx documentation. Does anyone know if it can be
              done? Or maybe a different package?</div>
            <div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica,
              sans-serif; font-size: 12pt; color: #000000;">Thanks - and
              stay safe!</div>
            <div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica,
              sans-serif; font-size: 12pt; color: #000000;">Steve
              Collins</div>
            <div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica,
              sans-serif; font-size: 12pt; color: #000000;"> </div>
            <p align="justify"> </p>
            <p align="justify">-- </p>
            <p align="justify">This e-mail and any attachments may
              contain confidential, copyright and or privileged
              material, and are for the use of the intended addressee
              only. If you are not the intended addressee or an
              authorised recipient of the addressee please notify us of
              receipt by returning the e-mail and do not use, copy,
              retain, distribute or disclose the information in or
              attached to the e-mail.<br>
              Any opinions expressed within this e-mail are those of the
              individual and not necessarily of Diamond Light Source
              Ltd. <br>
              Diamond Light Source Ltd. cannot guarantee that this
              e-mail or any attachments are free from viruses and we
              cannot accept liability for any damage which you may
              sustain as a result of software viruses which may be
              transmitted in or with the message.<br>
              Diamond Light Source Limited (company no. 4375679).
              Registered in England and Wales with its registered office
              at Diamond House, Harwell Science and Innovation Campus,
              Didcot, Oxfordshire, OX11 0DE, United Kingdom<br>
               </p>
          </div>
        </div>
        <br>
        <div class="pre" style="margin: 0; padding: 0; font-family:
          monospace">_______________________________________________<br>
          cctbxbb mailing list<br>
          <a href="mailto:cctbxbb@phenix-online.org"
            moz-do-not-send="true">cctbxbb@phenix-online.org</a><br>
          <a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/cctbxbb"
            target="_blank" rel="noopener noreferrer"
            moz-do-not-send="true">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/cctbxbb</a></div>
      </blockquote>
      <br>
      <fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
      <pre class="moz-quote-pre" wrap="">_______________________________________________
cctbxbb mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:cctbxbb@phenix-online.org">cctbxbb@phenix-online.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/cctbxbb">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/cctbxbb</a>
</pre>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>