<div dir="ltr">Hi I am trying to run the following command<br>phenix.twin_map_utils data.file=cy_p10_2_28.1_unique1.mtz model.file=cy_p10_2_28.1.pdb obs_labels=F_p10-2,SIGF_p10-2 free_flag=FreeR_flag<br><br>When I run phenix.twin_map_utils from phenix version 1.3 final or from the newest cci_aps. I get the following AssertionError ( see below).<br>
<br>I think my mtz file is kosher because phenix.refine with the twin_law option handles it well and I can refine with a twin law.<br><br>Is there something wrong in the syntax or the file.<br>I am attaching the log file with the Assertion Error to this email.<br>
Thanks for your help<br>Hari<br><br><br>&nbsp;<br>Overall and bulk solvent scale paranmeters and twin fraction estimation<br>=======================================================================<br>Traceback (most recent call last):<br>
&nbsp; File &quot;/Users/hari/cci_apps_sources/mmtbx/mmtbx/command_line/twin_map_utils.py&quot;, line 7, in &lt;module&gt;<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; twin_map_utils.run(args=sys.argv[1:])<br>&nbsp; File &quot;/Users/hari/cci_apps_sources/mmtbx/mmtbx/twinning/twin_map_utils.py&quot;, line 306, in run<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; out=log)<br>&nbsp; File &quot;/Users/hari/cci_apps_sources/mmtbx/mmtbx/twinning/twin_f_model.py&quot;, line 946, in __init__<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; assert self.f_obs.indices().all_eq( self.free_array.indices() )<br>AssertionError<br></div>