<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
<head>
  <meta content="text/html;charset=ISO-8859-1" http-equiv="Content-Type">
</head>
<body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
Pavel Afonine wrote:
<blockquote cite="mid:4AC57570.3000802@lbl.gov" type="cite">
  <meta content="text/html;charset=ISO-8859-1" http-equiv="Content-Type">
Hi,<br>
  <br>
phenix.refine model.pdb data.mtz main.ncs=true<br>
  <br>
will do refinement with NCS restraints. The NCS groups will be
determined automatically. It may be important to check the automatic
choice.<br>
See phenix.refine manual for details:<br>
  <a moz-do-not-send="true" class="moz-txt-link-freetext"
 href="http://phenix-online.org/documentation/refinement.htm#anch24">http://phenix-online.org/documentation/refinement.htm#anch24</a><br>
  <br>
Also, at this resolution you may consider using TLS and/or group ADP
refinement. <br>
  <br>
phenix.refine does not have NCS constrains, which I believe you do not
need at this resolution.<br>
  <br>
Pavel.<br>
  <br>
  <br>
</blockquote>
&nbsp; Hi Pavel,<br>
<br>
&nbsp;&nbsp; Got to disagree with you on this one.&nbsp; Depends on your obs to
params.&nbsp; If youve <br>
&nbsp;&nbsp; got 90% solvent then perhaps.......I would always favour reducing my
params by <br>
&nbsp;&nbsp; a factor of 5 at 3.6Angs.<br>
<br>
&nbsp; Jon&nbsp; <br>
<br>
&nbsp; PS&nbsp; Any plans for coding up NCS constraints !!!&nbsp;&nbsp; <span
 class="moz-smiley-s3"><span> ;-) </span></span><br>
<br>
<br>
<br>
<pre class="moz-signature" cols="72">-- 
Dr. Jonathan M. Grimes,   
University Research Lecturer
Division of Structural Biology
Wellcome Trust Centre for Human Genetics
University of Oxford
Roosevelt Drive,
Oxford OX3 7BN, UK

Email: <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:Jonathan@strubi.ox.ac.uk">Jonathan@strubi.ox.ac.uk</a>, Web: <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="http://www.strubi.ox.ac.uk">www.strubi.ox.ac.uk</a> 
Tel: (+44) - 1865 - 287561, FAX: (+44) - 1865 - 287547       
  
</pre>
</body>
</html>