<meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=utf-8">In fact<br>
<br>
<blockquote cite="mid:AANLkTinU0L=BpND+7jQNr+HWjsnDO3+prUS-08qeB0x-@mail.gmail.com" type="cite">
  <blockquote type="cite"><pre>       anisotropic = &quot;chain a&quot;<br>       anisotropic = &quot;chain f&quot;<br>       anisotropic = &quot;chain Y&quot;<br>       anisotropic = &quot;chain T&quot;<br>       anisotropic = &quot;chain U&quot;<br>
       anisotropic = &quot;chain z&quot;<br>       anisotropic = &quot;chain d&quot;<br>       anisotropic = &quot;chain g&quot;<br>       anisotropic = &quot;chain e&quot;<br>       anisotropic = &quot;chain V&quot;<br>       anisotropic = &quot;chain X&quot;<br>
       anisotropic = &quot;chain n&quot;<br></pre></blockquote>
</blockquote>
<br>
in this particular case it is equivalent to <br>
<br>
<blockquote cite="mid:AANLkTinU0L=BpND+7jQNr+HWjsnDO3+prUS-08qeB0x-@mail.gmail.com" type="cite">
  <pre>anisotropic = &quot;(chain a) or (chain f) or (chain Y) or (chain Y) or (chain U)&quot;<br><br>(and so on.)  <br></pre>
</blockquote>
<br>
However, when depositing to PDB please keep eye to make sure they do not
 capitalize the chain ids - otherwise it will be disastrous.<br>
<br>
Also, in this particular case selecting it visually could be painful.<br>
<br>
Pavel.<br>
<br><br><div class="gmail_quote">On Thu, Jan 6, 2011 at 11:50 AM, Christian Roth <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:christian.roth@bbz.uni-leipzig.de">christian.roth@bbz.uni-leipzig.de</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">
Dear all,<br>
<br>
I want refine a structure with several chlorides and want refine these chlorides<br>
anisotropic. I use the GUI for the setup and manipulate the eff file just before<br>
it starts. To my surprise my constrained group definitions are used, but my<br>
anistropic refinement definitions are removed I incorporated it as followed:<br>
 adp {<br>
      individual {<br>
        isotropic = None<br>
        anisotropic = &quot;chain a&quot;<br>
        anisotropic = &quot;chain f&quot;<br>
        anisotropic = &quot;chain Y&quot;<br>
        anisotropic = &quot;chain T&quot;<br>
        anisotropic = &quot;chain U&quot;<br>
        anisotropic = &quot;chain z&quot;<br>
        anisotropic = &quot;chain d&quot;<br>
        anisotropic = &quot;chain g&quot;<br>
        anisotropic = &quot;chain e&quot;<br>
        anisotropic = &quot;chain V&quot;<br>
        anisotropic = &quot;chain X&quot;<br>
        anisotropic = &quot;chain n&quot;<br>
      }<br>
but in the log the following is stated:<br>
adp {<br>
      individual {<br>
        anisotropic = &quot;chain a&quot;<br>
      }<br>
Why are all the other definitions gone? And if I defined it wrong, how I have to<br>
define it correctly?<br>
The current version I use is 1.6.4-486<br>
<br>
Thanks<br>
<br>
Christian<br>
_______________________________________________<br>
phenixbb mailing list<br>
<a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
<a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" target="_blank">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br>
</blockquote></div><br>