Thanks. Good to know it&#39;s not just me. :)<div><br></div><div>How might I know which structures do and don&#39;t require --use-model? I&#39;m running cif_as_mtz on the whole PDB so I can then run model_vs_data. If I know when to use that switch and when not to, I can mend my script accordingly.</div>

<div><br></div><div>Thanks. :)</div><div><br></div><div>Eric<br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Jun 13, 2012 at 10:59 AM, Nathaniel Echols <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:nechols@lbl.gov" target="_blank">nechols@lbl.gov</a>&gt;</span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div class="im">On Wed, Jun 13, 2012 at 7:36 AM, Eric Williams &lt;<a href="mailto:ericwilliams@pobox.com">ericwilliams@pobox.com</a>&gt; wrote:<br>


&gt; I&#39;m trying to run phenix.cif_as_mtz on a large number of PDB entries, and<br>
&gt; several entries give me an assertion error. The example below is from 8icz,<br>
&gt; but the error always seems to be the same.<br>
<br>
</div>This is a bug (which one of us will fix ASAP), but if you omit the<br>
--use-model argument, it should avoid the step that&#39;s crashing. �I<br>
haven&#39;t come across too many entries in the PDB that actually require<br>
this, especially among newer structures.<br>
<br>
-Nat<br>
_______________________________________________<br>
phenixbb mailing list<br>
<a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
<a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" target="_blank">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br>
</blockquote></div><br></div>