<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    <div class="moz-cite-prefix">Hi Alex,<br>
      <br>
      the optimal weights are not preserved for subsequent runs
      automatically because they may vary a lot even between
      macro-cycles. <br>
      If you want to reuse them, specify them manually (and turn off
      weights optimization) using fix_wxc and fix_wxu.<br>
      <br>
      More details here:<br>
      <a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.phenix-online.org/newsletter/CCN_2011_07.pdf">http://www.phenix-online.org/newsletter/CCN_2011_07.pdf</a><br>
      see "Improved target weight ..." article.<br>
      <br>
      Pavel<br>
      <br>
      On 10/19/12 2:04 AM, Alex Theodossis wrote:<br>
    </div>
    <blockquote
cite="mid:CAKUw-L5HcP=9b=5=k_SAjT9_gu9SxyG0NatV9kR0zh7ERNF+HQ@mail.gmail.com"
      type="cite">Dear bb,
      <div><br>
      </div>
      <div>I have made use of the target weight optimisation feature
        with great results.</div>
      <div><br>
      </div>
      <div>The question is, having optimised these weighting terms, how
        can I use the optimised values in subsequent runs without having
        to keep the optimisation option switched on?</div>
      <div><br>
      </div>
      <div>In the last round of refinement I get:</div>
      <div><br>
      </div>
      <div>Best XYZ weight: &nbsp; &nbsp;9.000</div>
      <div>Best ADP weight: &nbsp; &nbsp;0.695</div>
      <div><br>
      </div>
      <div>
        <div><br>
        </div>
        <div>But the output .eff file does not seem to have saved these
          values for use in subsequent refinements:</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>target_weights {</div>
        <div>&nbsp; &nbsp; optimize_xyz_weight = True</div>
        <div>&nbsp; &nbsp; optimize_adp_weight = True</div>
        <div>&nbsp; &nbsp; wxc_scale = 0.5</div>
        <div>&nbsp; &nbsp; wxu_scale = 1</div>
        <div>&nbsp; &nbsp; wc = 1</div>
        <div>&nbsp; &nbsp; wu = 1</div>
        <div>&nbsp; &nbsp; fix_wxc = None</div>
        <div>&nbsp; &nbsp; fix_wxu = None</div>
      </div>
      <div><br>
      </div>
      <div>Is it appropriate to enter the optimised values in the
        fix_wxc and fix_wxu fields?</div>
      <div><br>
      </div>
      <div>Thanks in advance</div>
      <div>
        <br>
      </div>
      <div><br>
      </div>
      <div><br>
      </div>
      <br>
      <fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
      <br>
      <pre wrap="">_______________________________________________
phenixbb mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a>
</pre>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>