<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=us-ascii"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">I suggest that whoever did the refinement does not yet understand Rfree nor how to keep it free. &nbsp;This can happen if an Rfree set is chosen after the structure or an essentially identical structure is solved.<div class="">For instance, choosing a different Rfree set for a liganded structure or a simple mutant that has already been refined using those spots in Rwork.<br class=""><div class=""><br class=""></div><div class="">G</div><div class=""><br class=""><div><blockquote type="cite" class=""><div class="">On Nov 20, 2014, at 8:52 AM, Singh, Bishal &lt;<a href="mailto:b.singh@dkfz-heidelberg.de" class="">b.singh@dkfz-heidelberg.de</a>&gt; wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><div class="">Hello everybody,<br class=""> While depositing a structure in PDB, I observed that Rwork was more than Rfree in the highest resolution shell and in a few more shells as well. I shall be delighted if somebody can suggest me the reasons and also what should I do now. <br class=""><br class="">With regards,<br class="">Bishal<br class="">PhD student,<br class="">DKFZ, University of Heidelberg, Germany<br class="">_______________________________________________<br class="">phenixbb mailing list<br class=""><a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org" class="">phenixbb@phenix-online.org</a><br class="">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb<br class=""><br class=""></div></blockquote></div><br class=""><div apple-content-edited="true" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class=""><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; border-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-stroke-width: 0px;"><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">George N. Phillips, Jr.<br class="">Ralph and Dorothy Looney Professor<br class="">BioSciences at Rice<br class="">Rice University, MS140<br class="">6100 Main Street<br class="">Houston, Texas &nbsp;77005-1892<br class="">Office: +1 713.348.6951<br class=""><a href="http://www.bioc.rice.edu/" class="">http://www.bioc.rice.edu/</a><br class=""><br class=""><br class=""></div></span></div>
</div>
<br class=""></div></div></body></html>