
<html><body><div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:HelveticaNeue, Helvetica Neue, Helvetica, Arial, Lucida Grande, sans-serif;font-size:16px"><div id="yui_3_16_0_1_1423793118015_11090" dir="ltr">Dear All,</div><div id="yui_3_16_0_1_1423793118015_11090" dir="ltr"><br></div><div id="yui_3_16_0_1_1423793118015_11090" dir="ltr">I find when I add H in the PDB file, in a refinement by Phenix, there is no real space refinement step (rsrl). If I do not add H in the PDB file, there is the rsrl step in the refinement.</div><div id="yui_3_16_0_1_1423793118015_11090" dir="ltr"><br></div><div id="yui_3_16_0_1_1423793118015_11090" dir="ltr">Somebody told me it was because there was a bug in the Phenix I downloaded, somebody told me if H added, there would be no real space refinement. I myself cannot clarify it by reading documents.</div><div id="yui_3_16_0_1_1423793118015_11090" dir="ltr"><br></div><div id="yui_3_16_0_1_1423793118015_11090" dir="ltr">Will you please clarify whether no rsrl step after H addition was because of bug or because of H addition leading to no rsrl step? And why H addition can lead to no rsrl step?</div><div id="yui_3_16_0_1_1423793118015_11090" dir="ltr"><br></div><div id="yui_3_16_0_1_1423793118015_11090" dir="ltr">I am looking forward to getting your reply.</div><div id="yui_3_16_0_1_1423793118015_11090" dir="ltr"><br></div><div id="yui_3_16_0_1_1423793118015_11090" dir="ltr">Best regards.</div><div id="yui_3_16_0_1_1423793118015_11090" dir="ltr"><br></div><div id="yui_3_16_0_1_1423793118015_11090" dir="ltr">Smith</div></div></body></html>