<div style="line-height:1.7;color:#000000;font-size:14px;font-family:Arial"><div>Dea<span style="line-height: 1.7;">d Andreas,</span></div><div><span style="line-height: 1.7;">&nbsp;</span></div><div><span style="line-height: 1.7;">For Phenix refine, will you please tell me the definition of the&nbsp;</span>convergence<span style="line-height: 1.7;">?</span></div><div><span style="line-height: 1.7;"><br></span></div><div><span style="line-height: 1.7;">I am looking forward to getting your reply.</span></div><div><span style="line-height: 1.7;"><br></span></div><div><span style="line-height: 1.7;">Smith</span></div><br><br><br><br><div></div><div id="divNeteaseMailCard"></div><br><pre><br>At 2015-02-20 20:02:31, "Andreas Förster" &lt;docandreas@gmail.com&gt; wrote:
&gt;Hi Smith,
&gt;
&gt;refinement shouldn't be done for three macrocycles or five but to 
&gt;convergence.  Do you think you've reached convergence?
&gt;
&gt;If your refinement result is unacceptable, as you say, you have to 
&gt;change your strategy or improve your model.
&gt;
&gt;Best.
&gt;
&gt;
&gt;Andreas
&gt;
&gt;
&gt;
&gt;
&gt;On 20/02/2015 11:56, Smith Liu wrote:
&gt;&gt; Dear All,
&gt;&gt;
&gt;&gt; The default number of cycles for the Phenix refinement graphical
&gt;&gt; interface is 3 (should be macro-cycles). I have done a refinement with 3
&gt;&gt; default cycles, and I get the acceptable refinement results. Then I kept
&gt;&gt; everything same, except I changed the cycles of refinement from 3 to 5,
&gt;&gt; however the refinement result was ugly which was unacceptable (Rfree
&gt;&gt; increased).
&gt;&gt; The Phenix document regards 5 macrocycles refine is fine. For my
&gt;&gt; situation, do you think the 3 macrocycles refine result is acceptable or
&gt;&gt; not? If not acceptable, what do you suggest for improvement?
&gt;&gt;
&gt;&gt; I am looking forward to getting your reply.
&gt;&gt;
&gt;&gt; Smith
&gt;&gt;
&gt;&gt;
&gt;&gt;
&gt;&gt;
&gt;&gt;
&gt;&gt;
&gt;&gt; _______________________________________________
&gt;&gt; phenixbb mailing list
&gt;&gt; phenixbb@phenix-online.org
&gt;&gt; http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb
&gt;&gt; Unsubscribe: phenixbb-leave@phenix-online.org
&gt;&gt;
</pre></div><br><br><span title="neteasefooter"><span id="netease_mail_footer"></span></span>