<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" style="display:none;"><!-- P {margin-top:0;margin-bottom:0;} --></style>
</head>
<body dir="ltr">
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:#000000;font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;" dir="ltr">
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0">Hello all,</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><br>
</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0">We are trying to install the new 1.13-2998 release of Phenix on 64 bit Linux CentOs 5 and have run into some problems. &nbsp;We are logged in as root, and we were able to unzip and untar the archive with no problem. &nbsp;However,
 when we run the install script, we immediately get the following errors:</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><br>
</p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo;">
<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures">root@linux7 phenix-installer-1.13-2998-intel-linux-2.6-x86_64-centos5]# ./install</span></p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo;">
<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures">Traceback (most recent call last):</span></p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo;">
<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures">&nbsp; File &quot;./bin/install.py&quot;, line 20, in ?</span></p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo;">
<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures">&nbsp; &nbsp; from libtbx.auto_build import install_distribution</span></p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo;">
<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures">&nbsp; File &quot;/usr/local/phenix-installer-1.13-2998-intel-linux-2.6-x86_64-centos5/lib/libtbx/auto_build/install_distribution.py&quot;, line 75, in ?</span></p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo;">
<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures">&nbsp; &nbsp; from libtbx.auto_build import install_base_packages</span></p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo;">
<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures">&nbsp; File &quot;/usr/local/phenix-installer-1.13-2998-intel-linux-2.6-x86_64-centos5/lib/libtbx/auto_build/install_base_packages.py&quot;, line 864</span></p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo;">
<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures">&nbsp; &nbsp; os.chmod(filename, 0o755)&nbsp; # set permissions to -rwxr-xr-x</span></p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo;">
<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures">&nbsp;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; ^</span></p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo;">
<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures">SyntaxError: invalid syntax</span></p>
<p></p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo;">
<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures">[root@linux7 phenix-installer-1.13-2998-intel-linux-2.6-x86_64-centos5]#</span></p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><br>
</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0">Any idea as to what the source of the problem is and how to get around it?</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><br>
</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0">Thanks for your help.</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><br>
</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0">Matthew Whitley</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><br>
</p>
<div id="Signature">
<div id="divtagdefaultwrapper" dir="ltr" style="font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif, Helvetica, EmojiFont, &quot;Apple Color Emoji&quot;, &quot;Segoe UI Emoji&quot;, NotoColorEmoji, &quot;Segoe UI Symbol&quot;, &quot;Android Emoji&quot;, EmojiSymbols;">
<div name="divtagdefaultwrapper" style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:; margin:0">
---
<div>Matthew J. Whitley, Ph.D.</div>
<div>Research Instructor</div>
<div>Department of Pharmacology &amp; Chemical Biology</div>
<div>University of Pittsburgh School of Medicine</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>