<html>
  <head>
    <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8">
  </head>
  <body>
    <p>Hi Dmitry,</p>
    <p>two options:</p>
    <p>1) The model file (PDB or mmCIF) contains symmetry information as
      BIOMT records and one asymmetric part of the molecule, then<br>
    </p>
    <p>phenix.pdb.biomt_reconstruction model.pdb</p>
    <p>will generate the whole 14mer.</p>
    <p>2) You have the map that covers the whole 14mer and the model
      (PDB or mmCIF) that contains only one one asymmetric part:</p>
    <p>- Get symmetry operators from the map using phenix.map_symmetry.<br>
      - Apply symmetry operators from the previous step to the model
      using phenix.apply_ncs to generate 14mer.</p>
    <p>All of the command line instructions above can also be run in the
      Phenix GUI.</p>
    <p>Pavel<br>
    </p>
    <div class="moz-cite-prefix">On 6/7/23 01:48, Dmitry A. Semchonok
      wrote:<br>
    </div>
    <blockquote type="cite"
      cite="mid:D88ACAB4-F88B-4E59-A7FB-C24A4A837646@hxcore.ol">
      <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8">
      <meta name="Generator" content="Microsoft Word 15 (filtered
        medium)">
      <style>@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0in;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri",sans-serif;}.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;}div.WordSection1
        {page:WordSection1;}</style>
      <div class="WordSection1">
        <div>
          <p class="MsoNormal">Dear colleagues,</p>
          <p class="MsoNormal">I want to symmetrise the monomer to
            complete the model (14 homo-oligomeric subunits) with D7
            symmetry.</p>
          <p class="MsoNormal">Is there a tool that can be used to
            multiply my monomer with D7 symmetry to fulfil the cryo-EM
            model?</p>
          <p class="MsoNormal">What are the steps for that?</p>
          <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
          <p class="MsoNormal">Thank you</p>
          <p class="MsoNormal">Kind regards,</p>
          <p class="MsoNormal">Dmitry</p>
        </div>
        <br>
      </div>
    </blockquote>
  </body>
</html>